鼋属于国家一级水生野生保护动物，资源濒危。珠江所龟鳖遗传育种创新团队自从2014年在全国率先成功开展鼋人工繁育以来，积极开展鼋保护生物学研究，扩大人工保种数量，不断推进鼋拯救行动计划，为该物种野外种群恢复奠定了夯实的物质和技术基础。

近日，龟鳖遗传育种创新团队在鼋保护生物学研究方面取得重要进展，团队构建了鼋染色体水平上的基因组精细图谱，在基因组水平上发现了与肿瘤抑制、生长和年龄相关基因候选基因发生了扩张，进化分析发现龟鳖的RSCU值相较于其它脊椎动物处于中间水平。基于建立的鼋参考基因组，构建了冬眠前后外周血单细胞图谱，发现并区分了正常状态和休眠期的细胞类型，为每个细胞亚群识别了一系列标记基因，确定了与应激反应相关的基因，为更好地解析冬眠的适应机制奠定了基础。针对鼋野外资源调查困难的现状，开发了基于线粒体ND5基因的鼋环境DNA检测技术，并在野外水域得到了应用，为鼋野外资源调查和放流效果评估提供了新的思路和辅助方法。围绕以姿势-动作-环境为中心，以生态功能为依据，构建并开展了人工培育下幼鼋的PAE行为谱等方面的行为学研究。系列研究为深入开展鼋保护生物学研究奠定了理论基础，为人工驯养管理及放流提供技术支撑。

相关研究成果以5篇论文的形式呈现。分别为“A chromosome-level genome assembly of the Asian giant softshell turtlePelochelys cantorii”发表于Scientific data, 2023, 10:754 (IF=9.8, JCR1区)，洪孝友助理研究员为第一作者，朱新平研究员和刘晓莉助理研究员为共同通讯作者；“Single-cell atlas reveals the hemocyte subpopulations and stress responses in Asian giant softshell turtle during hibernation”发表于Biology, 2023, 12:994 (IF=4.2, JCR2区)，洪孝友为第一作者，朱新平和刘晓莉为共同通讯作者；“Chromosome-level analysis of thePelochelys cantoriigenome provides insights to its immunity, growth and longevity”发表于Biology, 2023, 12:939 (IF=4.2, JCR2区)，刘晓莉为第一作者，朱新平和洪孝友为共同通讯作者；“Exploring the relationship between environmental DNA concentration and biomass in Asian giant softshell turtle (Pelochelys cantorii)”发表于PeerJ, 2023, 11:e16218 (IF=2.7, JCR2区)，洪孝友和研究生王开阔为第一作者，朱新平为通讯作者；“Behavior coding and ethogram of juvenile domesticated Asiangiant softshell turtles,Pelochelys cantorii”发表于Russian Journal of Herpetology, 2023, 30(3) (IF=0.7, JCR4区)，洪孝友为第一作者，朱新平为通讯作者。上述研究成果得到国家重点研发计划蓝色粮仓重点专项、中国-东盟联合基金、广东省自然基金面上项目、广州市科技计划重点项目、中国水产科学研究院珠江水产研究所基本科研业务费、农业农村部政府购买服务项目和广东农业农村厅一般性转移项目等的资助。

图1鼋染色体水平基因组情况

图2鼋的外周血细胞冬眠前后的单细胞图谱

图3不同地区鼋ND5引物扩增片段与对比

图4幼鼋捕食行为