日前,中国水产科学研究院黄海水产研究所虾贝类流行病学与疫病防控团队在全球高盐生态系统卤虫RNA病毒圈研究领域取得重要进展,相关研究成果以Diversity and connectedness of brine shrimp viruses in global hypersaline ecosystems为题发表在JCR一区国际期刊Science China Life Sciences。
高盐生态系统包括盐湖、盐沼等,具有高盐度、高冰点和溶氧变化快等特点,被视为“极端生态系统”。卤虫(Artemia)为广盐性生物,在全球高盐生态系统中均有分布,是水产养殖中重要的生物饵料。该研究对1977-2019年收集自六大洲、21个国家和100多个采样地的143批卤虫卵样本开展病毒组分析,鉴定到可归类为18个不同病毒家族和相关类群的55种新型RNA病毒,分析揭示出一些病毒间存在全球联系,特别是在亚洲和北美洲之间,发现人类活动可能推动了这些病毒间的全球关联性。研究揭示了卤虫中病毒的多样性,为了解全球高盐生态系统中以前未被认识的RNA病毒圈提供了新的见解。
黄海水产研究所董宣副研究员、山东第一医科大学李辞修副教授和黄海水产研究所硕士研究生王一婷为文章的共同第一作者,比利时根特大学Sorgeloos Patrick教授、天津科技大学亚洲区域卤虫参考中心隋丽英教授、黄海水产研究所黄倢研究员和山东第一医科大学史卫峰教授为文章的共同通讯作者。
研究得到国家重点研发计划(2018YFD0900501)、中国水产科学研究院黄海水产研究所基本科研业务费(20603022022005)、中国水产科学研究院基本科研业务费(2020TD39)、国家虾蟹产业技术体系(CARS-48)等项目的资助。
原文链接:
https://link.springer.com/article/10.1007/s11427-022-2366-8
图1 卤虫样本的分布及病毒鉴定
A:本研究中物种和病毒分布的热图
B:各文库中鉴定到的病毒信息
图2 卤虫中RNA病毒在不同地理位置和卤虫物种之间的分布
A:不同地理位置RNA病毒的比较
B:RNA病毒的地理分布
C:不同卤虫种间RNA病毒分布韦恩图
D:不同卤虫种间RNA病毒分布PCoA图
图3 本研究发现的RNA病毒基因组结构图