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珠江所龟鳖遗传育种创新团队在中华鳖性别研究领域取得新进展
2024-04-08 14:30:47  来源:珠江水产研究所

近日,珠江水产研究所育种室龟鳖遗传育种创新团队在中华鳖性别研究领域取得系列进展,相关研究成果“Identification of Sex-Specific Markers and Candidate Genes Using WGS Sequencing Reveals a ZW-Type Sex-Determination System in the Chinese Soft-Shell Turtle (Pelodiscus sinensis)”发表于International Journal of Molecular Sciences(JCR Q1,IF2022=5.60),祝骏贤博士和汪泳昌硕士为共同第一作者,朱新平研究员和李伟副研究员为共同通讯;“Whole-Genome Identification and Characterization of the DKK Gene Family and Its Transcription Profiles: An Analysis of the Chinese Soft-Shell Turtle (Pelodiscus sinensis)”发表于Animals(JCR Q1,IF2022=3.00),汪泳昌硕士和祝骏贤博士为共同第一作者,李伟副研究员和新疆农业大学张俊杰副教授为共同通讯。

上述研究得到了国家自然科学基金(32102792)、广东省农业农村厅种业振兴项目(2022-SJS-00-00;2022-SPY-00-015)和中国-东盟海洋合作基金(CAMC-2018F)等项目的资助。

研究开发了一套准确、高效的工作流程,用于筛选具有ZW或XY性别决定系统物种的性别特异性序列。基于该流程,对中华鳖雌性和雄性参考基因组进行了从头组装,经过两轮的比对和筛选,最终获得了4.01 Mb的雌性特异性序列,并开发了7对性别特异性引物,且在初步验证、群体验证和胚胎验证中准确率均为100%。通过对中华鳖雌性特异性序列的NR注释,发现了42个性别决定候选基因,其中包括RanEif4etCrkl等。功能注释的结果显示,8个KEGG通路被显著富集,其中胰岛素信号通路和cAMP信号通路与性别决定相关。研究为中华鳖性控育种和性别决定机制的研究提供了有利的分子工具和潜在的分子靶标。此外,研究还通过比较基因组研究,鉴定了中华鳖DKK基因家族成员,并通过系统发育、基因共线性、基因结构、蛋白结构域、保守motif、启动子保守位点、信号肽、转录因子、性腺转录谱和组织表达谱的系统分析,初步揭示了DKK基因家族成员在中华鳖性别发育中的潜在功能。




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